1/15/2014

Partek分析軟體 教學(四) 分析圖表- 其他簡易圖表

這邊來介紹一些Partek幾個簡單的小功能便可以畫出漂亮的圖表喔~~

Dot plot
步驟1.點選興趣的gene後,按滑鼠右鍵叫出功能表
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接著選擇Dot plot 後便會秀出圖形啦,如果覺的圖形可用來做報告或發表的話也可以利用功能列中的

Advanced Pathway Painter – Array data 基因分群的利器

前置作業:
篩選出的Gene List需事先存成特殊的txt檔案。方式如下:
i.先以excel開啟欲分析的檔案
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ii.可去除不必要的欄位,以免排版過微凌亂,但一定要保有Gene Symbol、RefSeq與 fold change 欄位
iii.另存新檔時在檔案類型地方選擇文字檔 Tab字元分隔
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流程:
1. 至http://pathway.painter.gsa-online.de/ 網站下載,並安裝程式
2. 安裝過程很簡單,因此不多加敘述
3. 可自己更新pathway的database