Array 分析常用名詞及圖示

Scatter plot：散點圖，X軸Cy3數據值，Y軸Cy5數據值，表示晶片上兩通道數據總體分佈集中趨勢。



MA-plot：是用來觀察晶片資料的分佈情況,以M (log ratio 表達量)為縱坐標，A(log intensity 表達量)為橫坐標做出資料的散點分佈圖。

Raw Data: 探針的掃瞄螢光信號強度原始數據
Normalized Ratio: 原始數據經過統計學方法標準化後的比值的對數，log₂(Exp/ Control)
p –value: T-test統計分析顯著差異表達的基因，p-value越小，該基因在兩樣本間差異表達越顯著
Quantile Normalization: 前提條件是假設n次實驗的資料具有相同的分佈，其演算法主要分為三步：

（1）對每張晶片的資料點排序。
（2）求出同一位置的幾次重複實驗資料的均值，並用該均值代替該位置的基因的表達量。
（3）將每個基因還原到本身的位置上。