篩選出的Gene List需事先存成特殊的txt檔案。方式如下:
i.先以excel開啟欲分析的檔案
ii.可去除不必要的欄位，以免排版過微凌亂，但一定要保有Gene Symbol、RefSeq與 fold change 欄位
iii.另存新檔時在檔案類型地方選擇文字檔 Tab字元分隔
流程:
1. 至http://pathway.painter.gsa-online.de/ 網站下載，並安裝程式
2. 安裝過程很簡單，因此不多加敘述
3. 可自己更新pathway的database
選擇你要下載的database以及物種，並按下update更新
4.分析過程也非常簡單，執行安裝後產生的Advanced Pathway Painter捷徑開啟程式。
5.將要分析的gene list input到軟體中。
6.將存好的TXT檔導入軟體
Filename: 選擇你想匯入的檔案
Values: 選擇Fold change 欄位
Gene/Protein names: 選擇Gene Symbol 欄位
Accession number: 選擇RefSeq欄位
7.點選左側要分析的LIST後，照順序點擊。
7.接著跳出新視窗，請勾選你想配對的Data base及物種，按下OK後軟體便會自動開始配對分析
8.分析結果
1 comment:
Gel Electrophoresis
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