miRNA發現的契機是源自1980年代初期,科學家們對於線蟲(Caenorhabditis elegans ; C. elegans )的研究。在英國劍橋分子生物研究所的Sulton、Ambros博士以及麻省理工學院的Horvitz教授等人,發現在線蟲lin-4、lin-14、lin-28 與lin-29 基因上的突變,會導致其後期胚胎發育發生時間控制上的異時(heterochronic)缺陷。隨後的研究進一步證實,由lin-4 基因所合成出一段約22個核苷酸(nucleotide)的非編碼(non-coding)RNA序列,能夠與lin-14 基因所
轉錄(transcript)出的RNA之3'端不轉譯區(3' untranslated region; 3'UTR)的七個位置,進行不完全互補(mismatch) 3 。因為這樣的調控機制,使得lin-4 基因在lin-14蛋白的轉譯(translate)過程中,扮演抑制的角色。
Microarray在Bioinformatics中現有的技術裡是一個不可或缺的角色,雖然未來有可能日漸被NGS取代,但令人不敢跨入的就是Data分析懂的人並不多。其實DATA分析現在很多商業化軟體都可以做得非常完善,但是還是有許多知識與分析步驟在起頭時仍需摸索,因此成立一個以中文為主的array分析部落格,收集相關資訊以及統計方法與步驟,讓台灣更多Lab對於Microarray的技術可以更加熟悉(當然價格親民還是得靠廠商),也歡迎相關領域的研究者在此互相分享學習。
8/23/2011
8/19/2011
GenBank
GenBank是一個有來自於70,000多種生物的核苷酸序列的資料庫。每條紀錄都有編碼區(CDS)特徵的注釋,還包括氨基酸的翻譯。GenBank屬於一個序列資料庫的國際合作組織,包括EMBL和DDBJ。
完整的GenBank資料庫包括序列檔,索引檔以及其它有關檔。索引檔是根據資料庫中作者、參考文獻等建立的,用於資料庫查詢。GenPept是由GenBank中的核酸序列翻譯而得到的蛋白質序列資料庫,其資料格式為FastA。
完整的GenBank資料庫包括序列檔,索引檔以及其它有關檔。索引檔是根據資料庫中作者、參考文獻等建立的,用於資料庫查詢。GenPept是由GenBank中的核酸序列翻譯而得到的蛋白質序列資料庫,其資料格式為FastA。
8/15/2011
miRNA extraction and quality
5/25/2011
統計分析之--Principle component analysis (PCA)
5/19/2011
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